Assessing the ability of chloroplast and nuclear DNA gene markers to verify the geographic origin of Jatoba (Hymenaea courbaril L.) timber

Abstract

La deforestación -reforzada por la tala ilegal- es un grave problema en muchas regiones tropicales y causa un daño ambiental y económico generalizado. Las leyes vigentes que pretenden reducir la tala ilegal necesitan métodos de control eficaces y resistentes al fraude. Hemos desarrollado una base de datos de referencia genética para la Jatoba (Hymenaea courbaril), una importante especie maderera de alto valor del Neotrópico. El conjunto de datos puede utilizarse para controlar las declaraciones de origen de la madera. Se han recogido muestras de 308 árboles de Hymenaea procedentes de 12 localidades de Brasil, Bolivia, Perú y la Guayana Francesa y se ha realizado el genotipado de 10 microsatélites nucleares (nSSRs), 13 SNPs del cloroplasto (cpSNP) y 1 marcador indel del cloroplasto. Los marcadores del gen del cloroplasto se han desarrollado utilizando la secuenciación de ADN de Illumina. El análisis bayesiano de conglomerados dividió a los individuos en base a los nSSRs en 8 grupos genéticos. Utilizando pruebas de auto-asignación, se ha probado el poder de la base de datos de referencia genética para juzgar las declaraciones sobre la localización para 3 métodos de asignación diferentes. Hemos observado una fuerte diferenciación genética entre las localizaciones, lo que ha dado lugar a unos índices de autoasignación elevados y fiables para las localizaciones entre el 50% y el 100% (media del 88%). Aunque los 3 métodos de asignación obtuvieron tasas medias de autoasignación similares, hubo diferencias para algunas localizaciones relacionadas con el nivel de diversidad genética, diferenciación y heterocigosidad. Nuestros resultados muestran que los marcadores genéticos nucleares y de cloroplasto son eficaces para ser utilizados en un sistema de certificación genética y pueden proporcionar a las autoridades nacionales e internacionales una herramienta sólida para confirmar la legalidad de la madera.