Please use this identifier to cite or link to this item: https://hdl.handle.net/20.500.12921/469
Title: Nuclear and plastid SNP markers for tracing Cedrela timber in the tropics
Authors: Paredes‑Villanueva, Kathelyn
Blanc‑Jolivet, Celine
Mader, Malte
Honorio Coronado, Eurídice
García Dávila, Carmen
Sebbenn, Alexandre M.
Meyer‑Sand, Barbara Rocha Venancio
Caron, Henri
Tysklind, Niklas
Cavers, Stephen
Degen, Bernd
Keywords: Cedrela odorata
Madera tropical
Polimorfismo de un solo nucleótido
Trazabilidad
Issue Date: Jul-2019
Publisher: Springer Nature
Citation: Paredes-Villanueva, Kathelyn; Blanc-Jolivet, Celine; Mader, Malte; Honorio Coronado, Eurídice N.; Garcia-Davila, Carmen; Sebbenn, Alexandre M.; Rocha Venancio Meyer-Sand, Barbara; Caron, Henri; Tysklind, Niklas; Cavers, Stephen; Degen, Bernd. 2020 Nuclear and plastid SNP markers for tracing Cedrela timber in the tropics. Conservation Genetics Resources, 12 (2). 239-244. https://doi.org/10.1007/s12686-019-01110-1
Abstract: La tala y el comercio ilegales de madera son una de las principales preocupaciones a nivel mundial, lo que provoca pérdidas económicas y de biodiversidad. Las especies arbóreas tropicales del género Cedrela, que han sido históricamente muy explotadas, siguen siendo a menudo objeto de comercio ilegal y es urgente desarrollar herramientas para verificar el origen de los productos de Cedrela. Se desarrolló un conjunto de 351 loci SNP para especies de Cedrela de Bolivia, Brasil, Costa Rica, Cuba, Ecuador, Guayana Francesa, México y Perú, utilizando la secuenciación de ADN asociada a la restricción (RADSeq) y la secuenciación genómica MiSeq de baja cobertura, y se adaptó para el genotipado MassARRAY. Tras el cribado de 94 individuos que cubrían la mayor parte de la distribución de Cedrela, se seleccionó un conjunto final de 136 loci SNP que incluía 92 SNP nucleares, 22 marcadores del cloroplasto (20 SNP y 2 INDEL) y 22 marcadores mitocondriales (19 SNP y 3 INDEL) y se comprobó su potencial para verificar el origen maderero de Cedrela.
URI: https://hdl.handle.net/20.500.12921/469
ISSN: 2213-7793
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