Timber Tracking of Jacaranda copaia from the Amazon Forest Using DNA Fingerprinting

Abstract

Investigamos la utilidad de los marcadores de polimorfismo de un solo nucleótido (SNP) nucleares y citoplasmáticos para el seguimiento de la madera del árbol amazónico Jacaranda copaia , de explotación y comercialización intensivas . Se muestrearon ochocientos treinta y dos árboles (cambium u hojas) de 38 sitios de muestreo en Bolivia, Brasil, Guayana Francesa y Perú. Se utilizaron un total de 128 marcadores SNP (113 nucleares, 11 cloroplásticos y 4 mitocondriales) para genotipificar las muestras. Se realizaron análisis de conglomerados bayesianos para agrupar individuos en grupos genéticos homogéneos para pruebas de autoasignación de grupos de individuos o individuos a su población de origen. El análisis de conglomerados basado en todos los marcadores SNP detectó siete grupos genéticos principales. La diferenciación genética fue alta entre poblaciones (0,484) y entre grupos genéticos (0,415), y las poblaciones mostraron un fuerte patrón de aislamiento por distancia. Las pruebas de autoasignación de los grupos de individuos para todos los loci permitieron determinar el origen poblacional de todas las muestras (precisión = 100%). Las pruebas de autoasignación de individuos permitieron determinar el origen del 94,5% al ​​100% de los individuos (precisión: 91,7%-100%). Nuestros resultados demuestran que el uso de los 128 marcadores SNP es adecuado para determinar correctamente el origen de la madera de J. copaia , y deberían considerarse una herramienta útil para las aduanas y la policía local e internacional.