Development of nuclear and plastid SNP and INDEL markers for population genetic studies and timber traceability of Carapa species
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Date
2019-03
Journal Title
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Publisher
Springer Nature
Abstract
Se utilizó la secuenciación genómica MiSeq de baja cobertura y la secuenciación de ADN asociada a la restricción (RADseq) para identificar marcadores genéticos SNP e INDEL nucleares y plastídicos en Carapa guianensis. Se describen 261 marcadores genéticos que incluyen 237 SNP nucleares, 22 SNP plastídicos y 2 INDEL plastídicos, basados en 96 individuos genotipados de Guayana Francesa, Brasil, Perú y Bolivia. Los 117 mejores SNPs para identificar la estructura de la población y realizar la asignación de individuos se reúnen en cuatro multiplex para el genotipado MassARRAY.
Description
Keywords
Carapa guianensis, Meliaceae, Genotipos, Trazabilidad, Huellas genéticas ADN, Polimorfismo de un solo nucleótido, Madera tropical, Carapa surinamensis
Citation
Tysklind, N., Blanc-Jolivet, C., Mader, M., Meyer-Sand, B. R., Paredes-Villanueva, K., Honorio Coronado, E. N., ... & Degen, B. (2019). Development of nuclear and plastid SNP and INDEL markers for population genetic studies and timber traceability of Carapa species. Conservation Genetics Resources, 11, 337-339.