Development of nuclear and plastid SNP markers for genetic studies of Dipteryx tree species in Amazonia

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dc.contributor.authorHonorio Coronado, Eurídice
dc.contributor.authorBlanc‑Jolivet, Celine
dc.contributor.authorMader, Malte
dc.contributor.authorGarcía Dávila, Carmen
dc.contributor.authorSebbenn, Alexandre M.
dc.contributor.authorMeyer‑Sand, Barbara Rocha Venancio
dc.contributor.authorParedes Villanueva, Kathelyn
dc.contributor.authorTysklind, Niklas
dc.contributor.authorTroispoux, Valerie
dc.contributor.authorMassot, Marie
dc.contributor.authorDegen, Bernd
dc.date.accessioned2020-03-05T16:23:51Z
dc.date.available2020-03-05T16:23:51Z
dc.date.issued2019-01
dc.description.abstractDesarrollamos marcadores de polimorfismo de un solo nucleótido (SNP) y de inserción/deleción (INDEL) para especies de Dipteryx utilizando una combinación de secuenciación de ADN asociada a la restricción (RADSeq) y secuenciación del genoma MiSeq de baja cobertura. Del total de 315 loci genotipados utilizando una plataforma MassARRAY, 292 loci fueron variables y polimórficos entre los 73 individuos muestreados de Guayana Francesa, Brasil, Perú y Bolivia. Se desarrolló un conjunto final de 56 SNPs nucleares, 26 SNPs de cloroplasto, 2 INDELs de cloroplasto y 32 SNPs mitocondriales que identifican una estructura poblacional significativa. Este conjunto de loci será útil para los estudios de genética poblacional de las especies de Dipteryx en la Amazonia.es_ES
dc.description.peer-reviewRevisión por pares.es_ES
dc.formatapplication/pdfes_ES
dc.identifier.citationHonorio Coronado, E. N., Blanc-Jolivet, C., Mader, M., García-Dávila, C. R., Sebbenn, A. M., Meyer-Sand, B. R., ... & Degen, B. (2019). Development of nuclear and plastid SNP markers for genetic studies of Dipteryx tree species in Amazonia. Conservation Genetics Resources, 11, 333-336.es_ES
dc.identifier.doihttps://doi.org/10.1007/s12686-019-01081-3es_ES
dc.identifier.issn1877-7260
dc.identifier.journalConservation Genetics Resourceses_ES
dc.identifier.urihttps://hdl.handle.net/20.500.12921/441
dc.language.isoenges_ES
dc.publisherSpringer Naturees_ES
dc.relationinfo:eu-repo/semantics/articlees_ES
dc.relation.urihttps://link.springer.com/article/10.1007/s12686-019-01081-3es_ES
dc.rightsinfo:eu-repo/semantics/closedAccesses_ES
dc.rights.urihttps://creativecommons.org/licenses/by/4.0/es_ES
dc.sourceInstituto de Investigaciones de la Amazonía Peruanaes_ES
dc.sourceRepositorio Institucional - IIAPes_ES
dc.subjectMarcadores genéticoses_ES
dc.subjectPolimorfismo de un solo nucleótidoes_ES
dc.subjectDipteryxes_ES
dc.subjectProcedenciaes_ES
dc.subjectMadera tropicales_ES
dc.subjectAmazoníaes_ES
dc.titleDevelopment of nuclear and plastid SNP markers for genetic studies of Dipteryx tree species in Amazoniaes_ES
dc.typeinfo:eu-repo/semantics/articlees_ES

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