Please use this identifier to cite or link to this item: https://hdl.handle.net/20.500.12921/441
Title: Development of nuclear and plastid SNP markers for genetic studies of Dipteryx tree species in Amazonia
Authors: Honorio Coronado, Eurídice
Blanc-Jolivet, Céline
Mader, Malte
García Dávila, Carmen
Sebbenn, Alexandre M.
Meyer Sand, Barbara R. V.
Paredes Villanueva, Kathelyn
Tysklind, Niklas
Troispoux, Valerie
Massot, Marie
Degen, Bernd
Keywords: Marcadores genéticos
Polimorfismo de un solo nucleótido
Dipteryx
Procedencia
Madera tropical
Amazonía
Issue Date: Jan-2019
Publisher: Springer Nature
Citation: Conservation Genetics Resources volume 11, pages333–336(2019).
Abstract: Desarrollamos marcadores de polimorfismo de un solo nucleótido (SNP) y de inserción/deleción (INDEL) para especies de Dipteryx utilizando una combinación de secuenciación de ADN asociada a la restricción (RADSeq) y secuenciación del genoma MiSeq de baja cobertura. Del total de 315 loci genotipados utilizando una plataforma MassARRAY, 292 loci fueron variables y polimórficos entre los 73 individuos muestreados de Guayana Francesa, Brasil, Perú y Bolivia. Se desarrolló un conjunto final de 56 SNPs nucleares, 26 SNPs de cloroplasto, 2 INDELs de cloroplasto y 32 SNPs mitocondriales que identifican una estructura poblacional significativa. Este conjunto de loci será útil para los estudios de genética poblacional de las especies de Dipteryx en la Amazonia.
URI: https://hdl.handle.net/20.500.12921/441
ISSN: 1877-7260
Appears in Collections:Artículos en revistas indexadas

Files in This Item:
File Description SizeFormat 
honorio_articulo_2019.pdf
  Until 2039-12-01
Texto Completo639,31 kBAdobe PDFThumbnail
View/Open Request a copy
Compartir :


This item is licensed under a Creative Commons License Creative Commons